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「Shopifyでストアを開設したけれど、在庫管理のやり方がよくわからない」「売上が伸びてきて、今の管理方法ではミスが起きそうで不安…」このような悩みを抱えていませんか。
在庫管理がずれると、欠品による機会損失（カゴ落ち）や過剰在庫によるキャッシュフローの悪化、誤出荷による顧客満足度の低下を招きかねません。本記事では、Shopifyの標準機能を使った基本的な在庫管理の方法から、複数モール展開を見据えたおすすめアプリ、外部システムとの連携までを完全ガイドします。
Shopifyには、追加のアプリを導入しなくても初期状態から優秀な在庫管理機能が備わっています。小規模〜中規模の単独ストアであれば、標準機能だけでも十分に運用が可能です。
Shopifyの標準機能でできる主な在庫管理は、以下の5つです。
それぞれ詳しく解説していきます。
Shopifyの管理画面では、商品ごとに現在の在庫数をリアルタイムで確認できます。「在庫を追跡する」設定を有効にしておくことで、在庫がゼロになった時点で自動的に「売り切れ（Sold Out）」表示に切り替わり、空売りのリスクを防げます。
顧客が購入すると在庫数が自動的に引き落とされるため、常に最新の在庫状況を把握することが可能です。
棚卸し時や実店舗での販売など、システムと実在庫にズレが生じた際は、管理画面から手動で在庫数を調整できます。商品数が多い場合はCSVファイルによる一括更新が便利で、数百〜数千アイテムの在庫を一度に最新の状態へ更新できます。
現在の在庫データをCSVでエクスポートし、Excelで数値を編集したあと再インポートするだけです。
売り切れ商品が並んだストアは、顧客に「品揃えが悪い」という印象を与えかねません。コレクション（商品カテゴリ）の設定で「在庫数が0より大きい商品」という条件を追加することで、在庫切れの商品を自動的にサイトから非表示にできます。
常に購入可能な商品だけを顧客にアピールでき、スムーズな購買体験を提供することが可能です。
Shopifyでは複数のロケーション（倉庫・実店舗・ポップアップストアなど）の在庫を一元管理でき、オンライン注文に対して顧客の配送先に最も近いロケーションから在庫を引き当てる高度なフルフィルメント設定も標準で可能です。
例えば「東京倉庫に50個、大阪店舗に20個」というように、拠点ごとに在庫を割り当てて管理できます。
「いつ・誰が・どの理由で在庫数を変更したか」という在庫履歴（ログ）を追跡できる機能も備わっています。入荷予定日や仕入れ先情報を記録しておくことで、次回の発注タイミングを見逃さず、適切な在庫水準を維持するためのデータとして活用できます。
これからShopifyでストアをオープンする方や、在庫管理機能をしっかり使っていなかった方に向けて、初期設定の基本ステップを解説します。以下の4つのステップを順番に行うことで、正確な在庫管理の土台が完成します。
それぞれ解説していきます。
管理画面の「商品管理」から各商品の詳細ページを開き、「在庫」セクションにある「在庫を追跡する」のチェックボックスにチェックを入れます。この設定を行わないと商品が無限に売れ続けてしまい、在庫切れによるクレームやキャンセル対応・返金処理といった余計な業務が発生します。
バリエーション（サイズや色）がある商品の場合は、各バリエーションごとに追跡設定が必要です。
SKU（Stock Keeping Unit）とは、在庫管理を行うための最小単位の識別コードです。例えば「Tシャツ・白・Mサイズ」であれば「TS-WHT-M」のような独自の英数字を設定します。SKUを正確に登録しておくことで、将来的に外部の在庫管理システムや物流倉庫（WMS）と連携する際にデータがスムーズに紐付きます。
バーコード（JANコードなど）がある場合もあわせて登録しておくと、実店舗での棚卸しが劇的に効率化されます。
管理画面の「設定」→「ロケーション」から、商品を保管している場所を登録します。自社倉庫・委託先の物流倉庫・実店舗など在庫が分散している場合はすべて追加し、各ロケーションへの在庫割り当てを行うことで正確な在庫引き当てが可能になります。
在庫がゼロになった場合の挙動を設定します。再入荷の予定が確実にある商品や受注生産品の場合は「在庫切れの場合でも販売を続ける」を有効にするバックオーダー（予約販売）を活用することで、機会損失を防げます。
ただし、顧客に「いつ発送できるか」を明確に伝えないとトラブルや返品の原因となるため注意が必要です。
ここまでShopifyの標準機能の優秀さを解説してきましたが、ビジネスの規模が拡大し販売チャネルが増えてくると、標準機能だけでは対応しきれない「壁」にぶつかります。主に以下の3つの課題が挙げられます。
それぞれ解説していきます。
楽天市場・Amazon・Yahoo!ショッピングなど複数モールへ多店舗展開を始めると、途端に在庫管理が破綻します。Shopifyの標準機能は外部モールとの在庫数を自動で同期できないため、手動での更新作業が発生し、タイムラグによる「売り越し（欠品）」のリスクが跳ね上がります。
「シャンプーとトリートメントのセット」や「福袋」など、複数の単品を組み合わせたセット販売を行う場合、標準機能では正確な在庫連動が困難です。セット商品が1つ売れたら構成する単品の在庫も自動的に減らす「構成品ごとの在庫引き当て」機能が標準には備わっておらず、手動での在庫調整を余儀なくされます。
Shopify POSという実店舗向けアプリがありますが、他店舗の在庫を確認して取り寄せ手配をするなどの高度な店舗管理は標準機能の範囲を超えます。既存のレガシーなPOSシステムをそのまま使いながらShopifyと在庫を同期させたい場合は、専用の連携アプリやAPI開発が必須となります。
前述した課題を乗り越え、EC事業をさらにスケールさせるにはシステムの拡張が必要です。Shopifyの「エコシステム」を活用し、以下の3つのアプローチから自社に最適な方法を選択しましょう。
それぞれ解説していきます。
最も手軽でコストパフォーマンスが高いのが、Shopify App Storeで提供されている在庫管理アプリの導入です。複数モールとの在庫同期アプリやセット商品の在庫計算に特化したアプリなど、特定の課題をピンポイントで解決するアプリが多数あり、月額数千円〜数万円程度で開発不要・即日利用開始できます。
月商が数千万円規模になり複数モールの受注件数が膨大になったら、Shopifyアプリだけでは処理しきれなくなります。「ネクストエンジン」や「クロスモール」などのOMS（受注管理システム）、あるいは「ロジレス」などのWMS（倉庫管理システム）とAPI連携することで、全チャネルの受注・在庫・出荷を完全に一元管理できます。
商品の保管から梱包・発送作業までの物流業務全般をアウトソーシングするアプローチです。オープンロジやヤマト運輸などとShopifyをシステム連携させれば、注文が入ると自動的に倉庫へ出荷指示が飛び、事業者は日々の在庫管理や発送業務から完全に解放されます。
マーケティングや商品開発にリソースを集中したい企業に最適な方法です。
Shopifyの在庫管理を効率化し、売上拡大を支えるための外部システムやアプリは数多く存在します。自社の規模や目的に合わせて選べる、実績豊富なおすすめツールを7つ厳選して紹介します。
それぞれ詳しく解説していきます。
ネクストエンジンは、国内シェアトップクラスを誇るクラウド型受注・在庫管理システム（OMS）です。Shopifyはもちろん、楽天市場・Amazon・Yahoo!ショッピングなど主要ECモールと連携し、在庫数や受注情報を24時間365日自動で同期することで、売り越し（欠品）のリスクを極限まで減らせます。
将来的に複数モールでの展開を視野に入れている事業者にとって、最も安心感のある選択肢です。
クロスモールはネクストエンジンと双璧をなす強力なOMSです。アパレルのようなサイズ・カラー展開（SKU）が多い商品や、福袋のような複雑なセット商品の在庫連動において、非常に柔軟できめ細かい設定が可能な点が強みです。
専任の担当者が導入から運用まで手厚くサポートしてくれるため、システムに不慣れな企業でも安心して導入できます。
「OMSのような大掛かりなシステムはまだ早いけれど、複数モールの在庫同期だけは自動化したい」というニーズにぴったりなのが、らくらく在庫です。「在庫数の同期」に機能を絞っているため月額費用が非常にリーズナブルで、Shopifyと他モールの併売を始めたばかりの初期〜中期フェーズのストアにコストパフォーマンス最強のツールです。
オープンロジは、商品の保管からピッキング・梱包・発送までの物流業務をすべて請け負うフルフィルメントサービスです。ShopifyとAPIで標準連携しており、注文が入ると自動的に倉庫へ出荷指示が飛ぶため、少人数で運営しているDCブランドや、急激な売上成長で出荷作業が追いつかないストアにとって心強い選択肢です。
Stocky（ストッキー）は、Shopifyが公式に提供している在庫管理アプリで、Shopify POS Proを利用している場合は無料で使えます。過去の販売データに基づいて「どの商品がいつどれくらい売れるか」を予測し、最適な発注タイミングや発注数を提案してくれるため、過剰在庫や機会損失を防ぐデータドリブンな在庫管理が実現します。
LOGILESSは、受注管理システム（OMS）と倉庫管理システム（WMS）が一体化したEC特化型のクラウドシステムです。Shopifyと連携することで注文の取り込みから倉庫への出荷指示までをほぼ100%自動化でき、特定の条件で出荷元を自動振り分けするような高度な物流ルーティングも可能です。
物流を戦略的な強みにしたい中〜大規模事業者向けのシステムです。
assisty（アシスティ）のInventory Managementは、Shopifyストアの在庫データをより深く分析・可視化するためのアプリです。「どの商品がどれくらいの期間滞留しているか（デッドストック）」「在庫回転率はどの程度か」といった標準機能では見えにくい在庫の健康状態をダッシュボードで表示し、不良在庫の早期発見に役立ちます。
assisty Inventory Managementの詳細はこちら
どんなに高機能なシステムを導入しても、運用する「人間のルール」が徹底されていなければ、必ず在庫のズレは発生します。以下の5つの運用ルールを社内で徹底することが重要です。
それぞれ詳しく解説していきます。
システム上の在庫数と実際の在庫数（実在庫）は、商品の紛失・破損・ピッキング時の数え間違いなどで必ずどこかにズレが生じます。月に1回、あるいは四半期に1回など定期的に棚卸し（実地カウント）を行い、Shopifyの在庫データを正確な数値にリセットする日を設けましょう。
放置すると「システム上は在庫があるのに実際には商品がなく発送できない」という最悪の事態を招きます。
「在庫が残り何個になったら追加発注をするか」という基準（発注点）を商品ごとに明確に定めておくことが重要です。リードタイム（発注から納品までの日数）が長い海外輸入商品は早めに発注し、国内ですぐ調達できる商品はギリギリまで在庫を持たないなど、商品特性に合わせたルール作りが必要です。
Shopifyの標準機能やStockyなどを活用して、在庫が一定数を下回った際のアラート設定をしておくと安心です。
在庫管理は「ただ数を合わせる」だけでなく、「売れるものを増やし、売れないものを減らす」マーケティング活動でもあります。Shopifyのレポート機能でABC分析（売上高の高い順に商品をランク付けする手法）を行い、「Aランク商品」は欠品させないよう在庫を手厚く持ち、「Cランク商品」は早急にセールで売り切る決断が必要です。
在庫のズレの多くは人為的なミスから発生します。「返品された商品をシステムに戻し忘れた」「サンプルとして持ち出した分をマイナスし忘れた」といったケースが典型です。「誰が・いつ・どのようにシステムを操作するのか」を明確にしたマニュアルを作成し、担当者全員に周知徹底することで属人化を排除し、誰が作業しても同じ結果になる仕組みを作りましょう。
通常の売買に加えて、在庫管理を最も複雑にするのが顧客からの「返品・交換・キャンセル」といったイレギュラーな対応です。返品された商品が良品であればShopifyの在庫に戻し、不良品であれば廃棄またはメーカー返品とするなど、状態に応じた処理フローを事前に決めておかないと、在庫データはあっという間に狂ってしまいます。
在庫管理において最も手間がかかりミスが発生しやすいのが、「返品・交換・キャンセル」の対応です。顧客とのやり取り・商品の状態確認・返金処理・在庫データへの反映をアナログで行っていると、担当者は疲弊し本来のマーケティング業務に手が回らなくなってしまいます。
在庫管理と顧客対応を劇的に効率化するための「2つの神ツール」を紹介します。
それぞれ解説していきます。
面倒な返品プロセスを完全に自動化・効率化できるのが、株式会社ネクストラボが提供する「返品くん」です。顧客自身が専用ポータル画面から数クリックで申請を完結できるため、カスタマーサポートへの電話・メールでの問い合わせを劇的に削減できます。
対応ステータスが自動で更新され、返品された商品が良品と確認されればスムーズに在庫データへ反映するための業務フロー構築を強力にサポートします。スムーズな返品体験を提供することで、顧客の安心感が高まりリピート率と売上の向上につながります。
出荷直前のキャンセル対応は、物流倉庫との連携ミスによる「誤出荷」を引き起こし、在庫データを狂わせる大きな原因となります。「バクアゲ」を導入すると、出荷手配が進む前の一定期間内であれば顧客自身でキャンセルや配送先変更が可能になり、キャンセルされた商品の在庫は即座にShopifyへ正確に戻ります。
顧客に「自分でコントロールできる」という安心感を与えることで、購入のハードルを下げ、長期的なファン（LTV向上）の獲得にも貢献します。
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Shopifyの在庫管理について、標準機能の活用方法から外部システム連携、運用ルールまでを網羅的に解説しました。本記事の重要ポイントをまとめます。
| ステージ | 対応策 |
| まずは基本を固める | リアルタイム追跡やロケーション管理など、標準機能を正しく設定する |
| 成長に合わせて拡張する | 複数モール展開が始まったらネクストエンジン・クロスモールなどのOMS、または物流アウトソーシングを検討 |
| 運用ルールを徹底する | 定期的な棚卸しや発注点の設定など、システムを動かす「人間のルール」が在庫の正確性を担保する |
| イレギュラー対応を自動化する | 在庫を狂わせる「返品・キャンセル」業務は「返品くん」や「バクアゲ」などの専用ツールで効率化する |
在庫管理は、ECサイト運営における「守り」の要です。この守りが強固であってこそ、広告やSNSを活用した「攻め」のマーケティングが最大限の効果を発揮します。ぜひ本記事を参考に、自社に最適な在庫管理環境を構築し、Shopifyストアのさらなる売上拡大を実現してください。
ECを運営する中で、このようなお悩みはありませんか？
「返品くん」は返品、交換業務をシンプルにし、円滑でストレスのないEC運営を実現させます！
返品くんを導入すると、月平均30時間かかる返品・交換作業が1/10のたった3時間まで削減可能。
顧客管理をコストダウンでき、伝票など紙ベースの作業も簡略化できることで、CS対応メンバーの満足度向上にもつながります。
世界的スニーカーブランドも返品くんを導入しており、導入前は日常的に返品・交換業務（メール、電話）が発生し、フルタイム4人体制でした。
返品くん導入後は、返品くん経由での問い合わせが全体7割となり自動化と返品・交換の省力化が 進み、CS体制4名から1名に。
3名はお問い合わせ業務ではなく、売上や顧客ケアをするアウトリーチ（攻めるCS）に従事して円滑なEC運営を実現しています。
従業員も顧客も満足なEC運営を実現する「返品くん」。まずはお気軽にお問合せください。
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